什么是conda？如何使用conda进行包管理？

iso:centos7.9

下载anaconda的安装包

[root@master01 ~]# wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-5.3.0-Linux-x86_64.sh

给执行权限

[root@master01 ~]# chmod +x Anaconda3-5.3.0-Linux-x86_64.sh

执行

[root@master01 ~]# ./Anaconda3-5.3.0-Linux-x86_64.sh

点击Enter（回车键）此时显示Anaconda的信息，并且会出现More，继续按Enter，直到如下图所示:

输入 yes

继续点击 Enter

输入 yes，添加环境变量

[root@master01 ~]# source /root/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh

[root@master01 ~]# conda -V
conda 4.5.11

阿里源

conda config –add channels  anaconda-cloud-Paddle安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-auto安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-biobakery安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-bioconda安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-c4aarch64安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-caffe2安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-conda-forge安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-deepmodeling安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-dglteam安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-fastai安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-fermi安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-idaholab安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-intel安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-matsci安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-menpo安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-mordred-descriptor安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-msys2安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-numba安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-ohmeta安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-omnia安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-plotly安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-psi4安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-pytorch安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-pytorch-test安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-pytorch3d安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-pyviz安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-qiime2安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-rapidsai安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-rdkit安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-simpleitk安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-stackless安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –add channels  anaconda-cloud-ursky安装包下载_开源镜像站-阿里云

conda config –set show_channel_urls yes

测试安装seqtk

[root@master01 ~]# conda create -n seqtk-env01 -y

[root@master01 ~]# conda activate seqtk-env01

(seqtk-env01) [root@master01 ~]# conda install -c bioconda seqtk

[root@master01 ~]# source deactivate