毕业设计:深度学习驱动的CT肺部结节病灶检测系统的Python实现
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前言
项目背景
数据集
设计思路
更多帮助
前言
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大家好,这里是海浪学长计算机毕设专题,本次分享的课题是
🎯基于深度学习的CT肺部结节病灶检测系统
项目背景
随着现代医学技术的迅猛发展,肺部疾病的早期诊断和治疗变得愈加重要。肺癌作为全球致死率最高的癌症之一,早期发现和诊断对于提高患者的生存率具有至关重要的作用。CT(计算机断层扫描)作为一种高分辨率的成像技术,能够清晰展示肺部结构,帮助医生识别肺部结节等病灶。然而,CT图像的解读依赖于专业放射科医生的经验,容易受到人为因素的影响,且工作量大,存在漏诊或误诊的风险研究和开发CT肺部结节病灶检测系统,不仅可以推动医学影像分析技术的发展,也为临床实践提供有效的技术支持。
数据集
数据采集主要来源于医院的CT影像数据库,涵盖多种类型的肺部结节病例。在采集过程中,需确保数据的多样性,包括不同的病例、不同的CT扫描仪和不同的扫描参数,以获得具有代表性的样本。利用专业的医学影像标注工具,由经验丰富的放射科医生对CT图像中的结节进行标注。标注过程包括绘制结节的边界框,标记结节类型(如良性或恶性),并记录结节的大小和位置等信息。
数据集需要进行划分与扩展。一般将数据集分为训练集、验证集和测试集,以便在模型训练和评估过程中进行有效的性能监测。同时,为了增强模型的鲁棒性,可以采用数据增强技术,如旋转、缩放和随机裁剪等,以增加样本的多样性。
设计思路
典型的卷积神经网络由四个部分构成:输入层,就是输入的图像;卷积层用于特征提取,自带激活函数一般使用的是线性整流函数;池化层用于缩小特征映射从而扩大卷积感受野,是降维的过程;全连接层类似传统神经网络的部分,通过权值矩阵将特征进行重组。一般使用Softmax激活函数用来输出想要的结果。
感受野指特征图上的一个像素对应原图多少尺寸的像素,一个普通卷积的过程,卷积核大小为3×3,步长为1。感受野相对于原图来说,即某层特征图中一个像素尺寸对应原图多少像素尺寸。在图像处理过程中,经常会用到矩阵卷积来计算图像的特征,矩阵卷积有两种:全卷积和有效值卷积。使用空洞卷积最主要的用途是增大感受野。
通过正向传播计算卷积层和池化层的激活值。在卷积层,数据以三维形式存在,在输入层CT图像属于灰度图片,仅有1个特征图,上一层的特征与对应的卷积核进行卷积运算,输出新的特征。池化分为平均池化和最大池化。假设进行池化操作使用的卷积核大小为2×2,如果使用平均池化,卷积核中每一个单元的权重都是0.25,平均池化的作用等于将原图模糊缩减为原来的1/4。如果采用最大池化的方法,卷积核中其中一个单元的权重是1,其余全部是0,最大池化的作用等于将原图缩减为原来的1/4,并保留每个2×2区域的最强输入。
U-Net是一种基于全卷积神经网络的语义分割网络。该网络有23层,有一个对称的结构,类似于字母U;因此,它被称为U-Net。U-Net结构前半部分进行特征提取,后半部分进行上采样,是一个编码器-解码器结构。在特征提取中,输入图像通过卷积层和池化层,得到不同层次的特征图,其中包含不同抽象层次的图像特征。在上采样过程中,利用反卷积层逐步恢复特征图的大小,并融合上采样的特征图,在低抽象程度的情况下修复训练过程中丢失的细节,以提高网络的分割精度。U-Net结构简单,层数少,训练不需要大量样本,训练速度快。U-Net模型是先通过四个下采样提取目标特征,再通过四个上采样,然后逐个对特征中每一个像素点进行分类,从而达到语义分割的目的。下采样的过程就是传统卷积神经网络的卷积层,先通过Conv2D进行卷积,然后进行批量正则化,接着进入ReLU激活函数层。其中核心的算法就是卷积的过程,通过卷积核在图像上移动,得到结果。
模型训练之前,需要准备好CT图像数据集。数据集通常包括CT扫描图像及其对应的标注(如肺部结节的掩码)。需要对数据进行预处理,包括图像的归一化、尺寸调整和数据增强,以提高模型的泛化能力。数据预处理可以通过图像增强(如旋转、翻转、缩放等)来扩展训练数据集,确保模型能够在多种情况下学习到有效的特征。将数据集划分为训练集、验证集和测试集。通常,70%用于训练,20%用于验证,10%用于测试。验证集用于调整超参数,而测试集用于评估模型的最终性能。
import os
import numpy as np
import cv2
from sklearn.model_selection import train_test_split
def load_data(data_dir, mask_dir):
images = []
masks = []
for filename in os.listdir(data_dir):
img = cv2.imread(os.path.join(data_dir, filename), cv2.IMREAD_GRAYSCALE)
mask = cv2.imread(os.path.join(mask_dir, filename), cv2.IMREAD_GRAYSCALE)
if img is not None and mask is not None:
images.append(img)
masks.append(mask)
return np.array(images), np.array(masks)
images, masks = load_data('path/to/images', 'path/to/masks')
images = images / 255.0 # 归一化
构建U-Net模型。U-Net由编码器和解码器组成,编码器用于提取特征,而解码器用于重建图像。U-Net通过跳跃连接将编码器的特征图与解码器的特征图结合,有助于保留空间信息。编译并训练U-Net模型。选择适当的损失函数(如交叉熵损失)和优化器(如Adam),并开始训练模型。可以使用回调函数进行监控和早停。训练过程中,模型会不断调整参数,以最小化损失函数,从而提高分割的准确性。监控训练过程中的指标(如IoU、Dice系数)可以帮助评估模型的性能。
import tensorflow as tf
from tensorflow.keras import layers, models
def unet_model(input_shape):
inputs = layers.Input(input_shape)
# 编码器
c1 = layers.Conv2D(64, (3, 3), activation='relu', padding='same')(inputs)
c1 = layers.Conv2D(64, (3, 3), activation='relu', padding='same')(c1)
p1 = layers.MaxPooling2D((2, 2))(c1)
# 解码器
c2 = layers.Conv2D(128, (3, 3), activation='relu', padding='same')(p1)
c2 = layers.Conv2D(128, (3, 3), activation='relu', padding='same')(c2)
u1 = layers.UpSampling2D((2, 2))(c2)
u1 = layers.concatenate([u1, c1])
outputs = layers.Conv2D(1, (1, 1), activation='sigmoid')(u1)
model = models.Model(inputs=[inputs], outputs=[outputs])
return model
model = unet_model((128, 128, 1)) # 输入尺寸根据实际情况调整
使用测试集评估训练好的模型。可以计算各种指标(如精确率、召回率、F1分数等),并生成相应的可视化结果,如混淆矩阵、ROC曲线等,分析模型的性能。通过评估指标,可以全面了解模型的效果,识别出模型在特定类型病灶上的强项和弱项,进而为进一步优化提供依据。对模型的预测结果进行可视化,展示原始图像、真实掩码和预测掩码,并分析其效果。
import matplotlib.pyplot as plt
def visualize_results(X, y_true, y_pred, num_images=5):
for i in range(num_images):
plt.figure(figsize=(12, 6))
plt.subplot(1, 3, 1)
plt.title('Original Image')
plt.imshow(X[i].squeeze(), cmap='gray')
plt.subplot(1, 3, 2)
plt.title('True Mask')
plt.imshow(y_true[i].squeeze(), cmap='gray')
plt.subplot(1, 3, 3)
plt.title('Predicted Mask')
plt.imshow(y_pred[i].squeeze(), cmap='gray')
plt.show()
visualize_results(X_test, y_test, y_pred_bin)
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作者:Mini_hailang_IT